Network System Laboratory - Backup diff of JupyterHub vs current(No. 26)

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--- 26: 2021-07-25 (Sun) 21:41:24 iseki
+++ Cur: 2023-12-04 (Mon) 11:30:44 iseki
@@ Line 10: / Line 10: @@
 - see also: ''[[Jupyter]]''
 - see also: [[Docker]], [[Podman]]
-- see also: [[Kubernetes]]
+- see also: [[Kubernetes]], [[PodmanSpawner]]
+- see also: [[configurable-http-proxy]]
 - [[DockerSpawner>./DockerSpawner]]
+- [[LTIDockerSpawner>./LTIDockerSpawner]]
+- [[LTIPodmanSpawner>./LTIPodmanSpawner]]
+- [[Moodle+JupyterHub]]
+- [[開発>./devel]]
+- [[API>./API]]
 #br
 ** INSTALL [#nfb5f43c]
+*** Rocky Linux 8 [#g6e6c1d1]
+- [[Detail Log>./RockyLinux8_install]]
+#br
+*** pip [#ecfe7cfb]
+#br
+*** conda [#n0e2837f]
+- conda update -c conda-forge jupyterhub -y
+#br
+*** for CentOS 8.5 with pip [#l08667b3]
+ # yum install python3
+ # pip3 install --upgrade pip
+ # yum install npm
+ # npm install -g configurable-http-proxy
+ # pip install setuptools_rust
+ # pip install jupyterhub
+ # pip install dockerspawner
+ # pip install --upgrade notebook
+ # pip install --upgrade jupyterlab
+ # jupyterhub --version
+ # jupyter --version
+ # jupyter notebook --version
+ # jupyter lab --version
+#br
+*** 2.0.0 with conda [#e269f8c5]
+**** Change Log [#qacdfa95]
+- https://jupyterhub.readthedocs.io/en/stable/changelog.html
+#br
+**** Install [#j385e508]
+ (base) # conda install -c conda-forge conda==4.11.0 -y
+ (base) # conda activate jupyterhub
+ (jupyterhub) # conda update -c conda-forge jupyterhub -y
+ (jupyterhub) # jupyterhub --upgrade-db
+ (jupyterhub) # jupyterhub -f .....
+#br
+**** podmanspawner.PodmanSpawner [#nefeece2]
+- おおっ class のサンプルに Podman がある！
+-- と思ったら niklas netter 氏の [[podmanspawner>https://github.com/gatoniel/podmanspawner]] じゃん
+#br
+**** websocket モジュールが無いとのことで起動しなくなった． [#x698e062]
+ ModuleNotFoundError: No module named 'websocket'
+- conda 環境で websocket をインストール
+ # conda install -c conda-forge websocket-client
+- pip なら　pip install websockets
+#br
+**** データベースのスキーマが合わないとのことで，起動しなくなった． [#o77e88b0]
+- jupyterhub upgrade-db してもだめなので，/var/lib/jupyterhub 以下を削除
+#br
+*** 1.4.2 [#i2818e12]
 **** conda を使用 [#z4c989ab]
  (base) # conda create -n jupyterhub python=3.8 -y
@@ Line 24: / Line 91: @@
  (jupyterhub) # conda install -c conda-forge voila -y
  (jupyterhub) # conda install jupyter_client -y
  (jupyterhub) # git clone https://github.com/jupyterhub/nativeauthenticator.git
  (jupyterhub) # pip install -e nativeauthenticator   (認証モジュール：オプション)
@@ Line 30: / Line 97: @@
 - ディレクトリのパーミッションの設定を忘れずに！
+#br
+**** pip を使用する． [#d08d0c8f]
+- nodejs: CentOS7 の場合は nodejs はバージョンが古くて，configurable-http-proxy でエラーが出るので，nodejs をバージョンアップする．
+ curl -sL https://rpm.nodesource.com/setup_14.x | bash -
+ yum remove nodejs npm -y
+ yum install nodejs -y
+ node -v
+--  nodejs のバージョンがアップしない場合は，/var/tmp/yum-root-* を消す
+-- https://rpm.nodesource.com/setup_##.x は非推奨となった．(2023/12/4)
+--- see https://github.com/nodesource/distributions
+ npm install -g configurable-http-proxy
+ python3 -m pip install jupyterhub
+ python3 -m pip install dockerspawner
+ python3 -m pip install --upgrade notebook
+ python3 -m pip install --upgrade jupyterlab
 #br
@@ Line 43: / Line 126: @@
 - (jupyterhub) # jupyterhub --version
 #br
+*** [[LTI Authenticator>LTI]] [#g284e3bf]
+- Moodle と連携する為の 認証モジュール（Moodleの外部サービスを使用）
+- 先に authlib を入れておく．
+-- conda install oauthlib  or pip  install oauthlib
+- v1.2.0 release (2021 9/2)
+-- https://pypi.org/project/jupyterhub-ltiauthenticator/1.2.0/
+-- Moodle に対して Patch 不要
+ (jupyterhub)# pip install --upgrade jupyterhub-ltiauthenticator
 ** 設定 [#idb49705]
@@ Line 111: / Line 205: @@
-**** LTIモジュール [#m4467ad6]
+**** [[LTI]] モジュール [#m4467ad6]
-***** Learning Tools Interoperability [#lde959fa]
-- https://github.com/jupyterhub/ltiauthenticator
-- 既にインストールされている ltiauthenticator だと Moodle にログインできない.
--- "Moodleと Jupyter Notebookの 連携 によるプログラミング 教育環境 の 構築" 石坂徹，桑田喜隆, et. al., Moodle Moot Japan 2019 Proceedings (2019), pp.32-37
---- /usr/local/anaconda/envs/jupyterhub/lib/python3.8/site-packages/ltiauthenticator/__init__.py
-             # Before we return lti_user_id, check to see if a canvas_custom_user_id was sent.
-             # If so, this indicates two things:
-             # 1. The request was sent from Canvas, not edX
-             # 2. The request was sent from a Canvas course not running in anonymous mode
-             # If this is the case we want to use the canvas ID to allow grade returns through the Canvas API
-             # If Canvas is running in anonymous mode, we\'ll still want the \'user_id\' (which is the `lti_user_id``)
-             canvas_id = handler.get_body_argument(\'custom_canvas_user_id\', default=None)
-+           product_code = handler.get_body_argument(\'tool_consumer_info_product_family_code\', default=None)
-             if canvas_id is not None:
-                 user_id = handler.get_body_argument(\'custom_canvas_user_id\')
-+           elif \'moodle\' in product_code:
-+                user_id = handler.get_body_argument(\'ext_user_username\')
-             else:
-                 user_id = handler.get_body_argument(\'user_id\')
-***** jupyterhub_config.py [#c6db4f7a]
- c.JupyterHub.authenticator_class = 'ltiauthenticator.LTIAuthenticator'
- c.LTIAuthenticator.consumers = {
-     os.environ['LTI_CLIENT_KEY']: os.environ['LTI_CLIENT_SECRET']
- }
--- キーは二つとも openssl rand -hex 32 で生成．
-#br
-***** Moodle 側 [#sd9e4f7f]
-- 「サイト管理」=> 「プラグイン」=> 「外部ツール：ツールを管理する」（=>「ツールを手動設定する」）
-- [[Hack>Moodle/Moodle-LTI]]
-#br
-***** error : module 'oauthlib.oauth1.rfc5849.signature' has no attribute 'signature_base_string' [#l6c7a130]
-- ライブラリが足りない
-- conda install oauthlib
-#br
-***** 欠点：利点？ [#w4038708]
--- %%一度 Moodle 経由でログインすると，ブラウザがアカウントを覚えているらしく，次回からは Moodle 経由で無くともログイン可能．%%　ログアウトすればOK
--- その他の一般ユーザ認証と併用できない．
 #br
@@ Line 218: / Line 269: @@
 - DockerSpawner を使用すると，作業ディレクトリが /home/jovyan/work 固定なのだが？
 - c.DockerSpawner.notebook_dir 辺りをいじっても変化しない？
-- 皆考えることは一緒：https://github.com/jupyter/docker-stacks/issues/358
+- https://github.com/jupyter/docker-stacks/issues/358
 #br
 ** 実行 [#a826d7f6]
+**** 前準備 [#xa875240]
+ # cd /etc/pki/tls
+ # openssl req -new -newkey rsa:2048 -days 3650 -nodes -keyout private/key.pem -out server.csr
+ # openssl x509 -in server.csr -days 3650 -req -signkey private/key.pem -out certs/server.pem
+ # vi  /usr/local/etc/jupyterhub/jupyterhub_config.py
+ # mkdir /var/lib/jupyterhub
+**** 実行 [#k5a94b0c]
  (base) # conda activate jupyterhub
  (jupyterhub) # jupyterhub -f /usr/local/etc/jupyterhub/jupyterhub_config.py
@@ Line 268: / Line 328: @@
 - pool_recycle の設定を忘れずに！
 - charset は urf8mb4
+#br
+** NVIDIA [#o78e60f8]
+*** Driver [#n52aa03b]
+**** nouveau ドライバ（デフォルトのグラフィックドライバ）を止める [#j9e3e782]
+- lsmod | grep nouveau  でドライバ確認
+- /etc/default/grab のオプションに rd.driver.blacklist=nouveau を追加
+- カーネル設定ファイルの作り直し
+-- grub2-mkconfig -o /boot/grub2/grub.cfg   (RedHat系)
+-- grub-mkconfig -o /boot/grub/grub.cfg   (Debian系)
+#br
+**** Driver [#r1aed2e1]
+- nvidia-driver, cuda をインストール
+#br
+**** Docker [#t87b07eb]
+- nvidia-container-toolkit が必要
+-- コンテナ内からホストのGPUを使う
+-- %%nvidia-smi などのコマンドがインストールされる．%%
+#br
+*** Tool Kit [#z51a5c81]
+- CUDA Toolkit : https://developer.nvidia.com/cuda-toolkit-archive
+- Tool Kit をインストールするとドライバもインストールされる？　（未確認）
+#br
+*** Docker [#xa8f93e3]
+- docker run --gpus all nvidia/cuda:12.2.0-devel-ubuntu20.04 nvidia-smi
+-- Failed to initialize NVML: Unknown Error
+-- ホストの /etc/nvidia-container-runtime/config.toml を編集して，no-cgroups = false にする．
 #br
 ** Trouble Shooting [#rf83821d]
+*** ltiauthenticator [#s373921d]
+- https://pypi.org/project/jupyterhub-ltiauthenticator/
+#br
+**** Jupyterhub 4.0.0 [#b81f6caf]
+- 403 : Forbidden  '_xsrf' argument missing from POST  のエラー
+-- JupyterHub で XSRFのチェックを強化したらしい
+- /usr/local/lib/python3.9/site-packages/jupyterhub/handlers/base.py
+-- def check_xsrf_cookie(self)
+--- super().check_xsrf_cookie() で例外発生
+--- 親は tornado のRequestHandlerか？
+- 2023 5/29 時点でこのバグは修正されている．
+#br
+*** JupyterLab [#m9f4d2fd]
+**** JupyterHub をバージョンアップしたら Jupyter Labが起動しなくなった． [#f644f8af]
+- 起動する JupyterHub（ex. 2.0.1）とイメージ内のJupyterHub（ex. 1.4.1）が違うとデフォルトで Jupyter Labが起動しなくなるようだ．
+#br
 *** 日本語のBUG [#ece06e7b]
@@ Line 294: / Line 402: @@
 *** homeディレクトの名前を変えたら，ログインできなくなった [#yf5e6b43]
 - ~/.cache, ~/.jupyter, ~/.local ができているので消す．
+#br
+*** Programing [#uef8ed38]
+**** docker [#g330446b]
+- https://docker-py.readthedocs.io/en/stable/api.html
+#br
+- APIClient 呼び出しメソッド順
+-- inspect_image
+-- inspect_container
+-- inspect_image
+-- start
+-- port
+#br
+**** podman [#u96870cc]
 #br

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