Network System Laboratory - Jupyter のバックアップの現在との差分(No.6)

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Jupyter へ行く。

--- 6: 2020-08-16 (日) 19:04:38 iseki
+++ 現: 2023-04-26 (水) 09:34:57 iseki
@@ Line 1: / Line 1: @@
 * Jupyter [#ud5a4e75]
+- python で書かれた Webアプリケーションによる教育・開発用環境
+- see also : [[JupyterHub]] (マルチユーザ用 Jupiter サーバ)
+- see also : [[Python]]
+#br
 ** Jupyter Notebook [#d5ab1922]
+- クライアント・サーバモデルであるが，基本的に個人（シングルユーザ）用
+#br
 *** With Anaconda [#wf6eba52]
@@ Line 6: / Line 13: @@
 - 色々調べると [[Anaconda]] の方が使い易い様子．というか，Anaconda には最初からデフォルトで Jupyter Notebook が入っている！
-- (base) jupyter notebook --allow-root
+- (base) jupyter notebook --allow-root --ip=0.0.0.0
-- (base) jupyter lab --allow-root
+- (base) jupyter lab --allow-root --ip=0.0.0.0
+#br
+- その後，「データサインティスト以外は Anaconda は使用しばい方が良い」との記事を見つける．
+-- Anacondaでは足りないパッケージがあって，結局 pip でそれらを追加していくと，どこかで環境が破壊される可能性があるみたい．
 #br
 *** Install [#nb5b4afb]
- (base) conda install -c conda-forge notebook
+**** anaconda [#b557ba40]
-#br
+- anaconda を入れる
-**** C/C++ サポート [#o92991fb]
+- anaconda 環境で conda を使ってインストールする
- (base) conda install -c conda-forge xeus-cling
+ (base) # conda install -c conda-forge notebook
- (base) pip install jupyter-c-kernel
- (base) install_c_kernel --sys-prefix
+- C/C++ サポート
- (base) jupyter kernelspec list
+ (base) # conda install -c conda-forge xeus-cling
+ (base) # pip install jupyter_c_kernel
+ (base) # install_c_kernel --sys-prefix
+ (base) # jupyter kernelspec list
+- ''xeus-cling'' は anaconda 環境 (conda init) でないとインストールできないかも
 - install_c_kernel で --sys-prefix を付けないと，C用のカーネルがユーザ環境に入る．削除する場合は ''jupyter kernelspec remove c''
+#br
+**** pip を使用する． [#d08d0c8f]
+ yum install nodejs
+ yum install python3-pip
+ pip install numpy scipy matplotlib seaborn scikit-learn pandas psycopg2 ipython-sql pymysql
+ pip install jupyter
+ pip install notebook
+ pip install jupyterlab
+ jupyter notebook --version
+ jupyter lab --versopn
 #br
 *** 設定 [#m0eb2396]
 以下のコマンドで設定ファイル ''~/.jupyter/jupyter_notebook_config.py'' が生成される
- # jupyter notebook --generate-config
+ (base) # jupyter notebook --generate-config
 - リモートマシンからの接続を許可するには ''c.NotebookApp.ip = '0.0.0.0' ''とする．
 #br
 *** 実行 [#rf0092bb]
- # jupyter notebook --allow-root
+ (base) # jupyter notebook --allow-root  --ip=0.0.0.0
 - port: 8888
 #br
+*** サブコマンド [#gaf0dfa1]
+- jupyter [subcommand] を実行することと，jupyter-[subcommand] を実行することは同じ．
+ $ \ls jupyter-*
+ jupyter-bundlerextension     jupyter-kernel        jupyter-labhub       jupyter-nbextensions_configurator  jupyter-serverextension
+ jupyter-contrib              jupyter-kernelspec    jupyter-migrate      jupyter-notebook                   jupyter-troubleshoot
+ jupyter-contrib-nbextension  jupyter-lab           jupyter-nbconvert    jupyter-run                        jupyter-trust
+ jupyter-extension            jupyter-labextension  jupyter-nbextension  jupyter-server
 ** JupyterLab [#b387f244]
+*** 設定 [#n53dd1dd]
 - Jupyter Notebookの後継. WebアプリケーションによるIDE
 - ''jupyterhub_config.py'' で ''c.Spawner.default_url = '/lab''' とする
- Install
+- Install
- (base) conda install -c conda-forge jupyterlab -y
+ (base) # conda install -c conda-forge jupyterlab -y
+- アクセス中にクラシックノートブックにアクセスするには ''/user/{username}/tree'' にアクセス
+-- /lab に戻るには ''/user/{username}/lab'' にアクセス
+#br
+*** Command [#ucb0d3d2]
+**** Update [#gaa53fb8]
+- conda update -c conda-forge jupyterlab
+- jupyter labextension update --all
+-- Node.js（nodejs >=12.0.0）が必要
 #br
-** JupyterHub [#mb71944e]
+**** Version [#p44ac111]
-- Jupyterサーバー（ユーザ認証機能つき）
+- jupyter lab --version
-- https://horomary.hatenablog.com/entry/2019/11/09/181614
 #br
-*** INSTALL [#nfb5f43c]
+** 拡張機能 [#gc7026e3]
- (base) conda create -n jupyterhub python=3.8 -y
+- https://www.hinomaruc.com/jupyter-notebook-five-extensions-recommendation/
- (base) conda activate jupyterhub
+#br
- (jupyterhub) conda install -c conda-forge notebook -y
- (jupyterhub) conda install -c conda-forge jupyterlab -y
- (jupyterhub) conda install -c conda-forge jupyterhub -y
- (jupyterhub) conda install -c conda-forge voila -y
- (jupyterhub) conda install jupyter_client -y
- (jupyterhub) git clone https://github.com/jupyterhub/nativeauthenticator.git
+*** nbextensions [#y4176ad9]
- (jupyterhub) pip install -e nativeauthenticator
+- jupyter nbextension list
- (jupyterhub) pip install dockerspawner
 #br
-*** 設定 [#idb49705]
+**** nbextensions_configurator [#l00f0361]
-- jupyterhub --generate-config を実行すると カレントディレクトリに設定ファイル ''jupyterhub_config.py'' が生成される．
+- ブラウザのタブ上で nbextensions の切り替えができる．
-- 個人的には jupyterhub が /usr/local 以下にある場合は /usr/local/etc/jupyterhub 以下に置く．
+-  --user オプションを付けると個人環境にインストールされる
+ (jupyterhub) # pip install jupyter_nbextensions_configurator
+ (jupyterhub) # jupyter nbextensions_configurator enable --user
 #br
-*** 実行 [#a826d7f6]
+**** contrib-nbextensions [#ob2b83de]
- (base) conda activate jupyterhub
+- 拡張機能
- (jupyterhub) jupyterhub --no-ssl -f /usr/local/etc/jupyterhub/jupyterhub_config.py
+-  --user オプションを付けると個人環境にインストールされる
-**** 使用ポート [#me192c34]
+ (jupyterhub) # pip install jupyter-contrib-nbextensions
-- 8000
+ (jupyterhub) # jupyter contrib nbextension install --user
-- 8081
 #br
-*** jovyan って誰？ [#w4a21247]
+**** JupyterHub でのコンテナ設定 [#a7fba7eb]
-- Docker を使用すると，作業ディレクトリが /home/jovyan/work 固定なのだが？
+- Dockerfile
-- c.DockerSpawner.notebook_dir 辺りをいじっても変化しない？
+ RUN  /opt/conda/bin/conda install -c conda-forge jupyter_contrib_nbextensions -y
+ RUN  /opt/conda/bin/conda install -c conda-forge jupyter_nbextensions_configurator -y
+ RUN  /opt/conda/bin/jupyter nbextension install --sys-prefix --py jupyter_nbextensions_configurator --overwrite
+ RUN  /opt/conda/bin/jupyter nbextension enable  --sys-prefix --py jupyter_nbextensions_configurator
+ RUN  /opt/conda/bin/jupyter serverextension enable --sys-prefix --py jupyter_nbextensions_configurator
 #br
-** Trouble Shooting [#rf83821d]
+**** nbgrader [#s1bead70]
+- https://github.com/jupyter/nbgrader
+- Lab では動かんようだ．
+#br
+*** labextensions [#sb566b8b]
+- jupyter labextension list
+#br
+** ショートカットキー [#c2704792]
+- https://qiita.com/zawawahoge/items/baa2a5318df079c5f7e5
+#br
+** Accessibility [#l661cb8c]
+- https://jupyter-accessibility.readthedocs.io/en/latest/index.html
+#br
+*** JupyterLab [#vb38bee0]
+- https://github.com/Quansight-Labs/jupyter-a11y-mgmt/issues/173 （開発中）
+#br
+*** Notebook [#nb19346f]
+- [[Jupyter Notebook a11y toolbar>https://github.com/uclixnjupyternbaccessibility/jupyter_contrib_nbextensions/tree/master/src/jupyter_contrib_nbextensions/nbextensions/accessibility_toolbar]] 2019年で開発停止
+- [[NVDA Browser Nav add-on>https://addons.nvda-project.org/addons/browsernav.en.html#:~:text=BrowserNav%20addon%20for%20NVDA,comments%20or%20malformed%20HTML%20tables.%E2%80%9D]] （これはNVDA用のアドオン）
-*** JupyterHub: PAM使用時に 再login するとPAMの認証エラーになる． [#cec1cefc]
-- バグだろ．
-- Resolve: jupyterhub_config.py に ''c.PAMAuthenticator.open_sessions = False'' を追加する
-- see: https://github.com/jupyterhub/jupyterhub/issues/486
 #br

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